Изменение рецепторной специфичности вируса ЕСНO11 при адаптации к культуре клеток BGM не связано с межвидовыми различиями рецептора DAF у человека и африканской зеленой мартышки

Abstract

Целью работы явилось картирование мутаций, связанных с адаптацией вируса ECHO11, полученного на культуре клеток RD (рабдомиосаркома человека) к культуре обезьяньих клеток BGM, в результате которой субвариант 111/ BGM не утратил аффинностьк рецептору DAF человеческого происхождения. Проведено секвенирование структурной части генома исходного клона и адаптированного к BGM субварианта. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей показал наличие у адаптированного субварианта двух мутаций, приводящих к аминокислотным заменам К88Е и Q129R в белке VP1. Обе аминокислотные замены локализованы за пределами области вирусного антирецептора для DAF,na поверхности северной стены каньона и её продолжения в сторону выступов вокруг осей симметрии 5-го порядка. Это позволило предположить, что альтернативный по отношению к DAF клеточный рецептор взаимодействует с поверхностью вируса ЕСН011 в области каньона.