Генотипирование изоляторов Mycobacterium tuberculosis гpyппы non-Beijing, циркулирующих в Уральском регионе

Abstract

A total of 80 Mycobacterium tuberculosis isolates, nonBeijing genotype from newly detectedTB patients, living in Ural region of Russia, were studied by using MIRU-VNTR typing and spoligotyping.Mutations associated with resistance to isoniazid and rifampicin were detected by microchip technology («TB-Biochip»). The discrimination powers of 15 locus MIRU-VNTR genotyping and spoligotyping were 0,99 and 0,97 respectively. Some MIRU-VNTR clusters may contain isolates with different spoligotypes and may differ in drug mutation. Predominant groups of isolates accordingto MIRU-VNTR data were LAM(31,25%) nUral(26,25%).

Методами MIRU-VNTRn сполиготипирования проведено генотипирование 80 изолятов Mycobacterium tuberculosis гpyппы nonBeijing, выделенных от вновь выявленных больных туберкулезом легких - жителей Уральского региона. Мутации, обуславливающие лекарственную устойчивость к рифампицину и изониазиду, были определены тест-системой «ТБ-Биочип». Дискриминирующие способности 15-локусного MIRU-VNTR типирования и сполиготипирования составили 0,99 и 0,97 соответственно. Некоторые VNTR-кластеры могут содержать изоляты различающиеся сполиготипами и спектром мутаций устойчивости к рифампицину и изониазиду. Среди изолятов non-Beijing, по данным MIRU-VNTR типирования,преобладали представители генетических групп: LAM(31.25%) и Ural(26,25%).