Оценка возможности использования ДНК архивных тканей, хранившихся в виде фиксированных в формалине и залитых в парафиновые блоки, в молекулярно-генетических исследованиях

Abstract

This study assessed the potential for use of DNA extracted from FFPE tissues in relation to the shelf life of paraffin blocks containing fixed tissues and analysis techniques. DNA extracted from fixed tissues embedded in paraffin blocks with various shelf lives was 100% suitable for genotyping by MALDI-TOF mass spectrometry. DNA was shown to be 100% suitable for PCR-RFLP analyses if extracted from paraffin blocks stored less than 10 years and 67.7% suitable for FFPE tissue shelf life more than 10 years. Potential for use of FFPE tissues depends only on the DNA quality.

Проведена оценка возможности использования ДНК, выделенной из тканей, архивных фиксированных в формалине и залитых в парафиновые блоки (ФФПБ), в зависимости от срока хранения тканей и метода исследования. Для генотипирования методом MALDI-T0F масс-спектрометрии ДНК, выделенная из ФФПБ разных сроков хранения, пригодна в 100%. Для исследований методом ПЦР-ПДРФ ДНК пригодна в 100% при хранении ФФПБ менее 10 лет, и в 67,7% - при хранении ФФПБ более 10 лет. Возможность успешного использования ФФПБ определяется только сохранностью ДНК.